Calculate the average nearest neighbor degree of the given vertices and the same quantity in the function of vertex degree
Arguments
- graph
The input graph. It may be directed.
- vids
The vertices for which the calculation is performed. Normally it includes all vertices. Note, that if not all vertices are given here, then both ‘
knn’ and ‘knnk’ will be calculated based on the given vertices only.- mode
Character constant to indicate the type of neighbors to consider in directed graphs.
outconsiders out-neighbors,inconsiders in-neighbors andallignores edge directions.- neighbor.degree.mode
The type of degree to average in directed graphs.
outaverages out-degrees,inaverages in-degrees andallignores edge directions for the degree calculation.- weights
Weight vector. If the graph has a
weightedge attribute, then this is used by default. If this argument is given, then vertex strength (seestrength()) is used instead of vertex degree. But note thatknnkis still given in the function of the normal vertex degree. Weights are are used to calculate a weighted degree (also calledstrength()) instead of the degree.
Value
A list with two members:
- knn
A numeric vector giving the average nearest neighbor degree for all vertices in
vids.- knnk
A numeric vector, its length is the maximum (total) vertex degree in the graph. The first element is the average nearest neighbor degree of vertices with degree one, etc.
Details
Note that for zero degree vertices the answer in ‘knn’ is
NaN (zero divided by zero), the same is true for ‘knnk’
if a given degree never appears in the network.
The weighted version computes a weighted average of the neighbor degrees as
k_nn_u = 1/s_u sum_v w_uv k_v,
where s_u = sum_v w_uv is the sum of the incident edge weights
of vertex u, i.e. its strength.
The sum runs over the neighbors v of vertex u
as indicated by mode. w_uv denotes the weighted adjacency matrix
and k_v is the neighbors' degree, specified by neighbor_degree_mode.
References
Alain Barrat, Marc Barthelemy, Romualdo Pastor-Satorras, Alessandro Vespignani: The architecture of complex weighted networks, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 3747 (2004)
See also
Other structural.properties:
bfs(),
component_distribution(),
connect(),
constraint(),
coreness(),
degree(),
dfs(),
distance_table(),
edge_density(),
feedback_arc_set(),
girth(),
is_dag(),
is_matching(),
laplacian_matrix(),
reciprocity(),
subcomponent(),
subgraph(),
topo_sort(),
transitivity(),
unfold_tree(),
which_multiple(),
which_mutual()
Author
Gabor Csardi csardi.gabor@gmail.com
Examples
# Some trivial ones
g <- make_ring(10)
knn(g)
#> $knn
#> [1] 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2
#>
#> $knnk
#> [1] NaN 2
#>
g2 <- make_star(10)
knn(g2)
#> $knn
#> [1] 1 9 9 9 9 9 9 9 9 9
#>
#> $knnk
#> [1] 9 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1
#>
# A scale-free one, try to plot 'knnk'
g3 <- sample_pa(1000, m = 5)
knn(g3)
#> $knn
#> [1] 14.560241 14.943038 13.635359 14.597183 16.182759 71.538462
#> [7] 18.277487 16.269841 85.095238 66.800000 22.737864 19.278912
#> [13] 32.855072 27.060976 50.675676 48.923077 30.457627 27.850000
#> [19] 22.421053 96.733333 30.268657 115.583333 34.142857 19.081395
#> [25] 48.473684 61.923077 54.028571 47.676471 53.241379 86.687500
#> [31] 59.375000 33.931818 64.625000 18.161765 117.545455 56.407407
#> [37] 28.416667 40.576923 46.523810 35.156250 33.464286 84.300000
#> [43] 43.580645 65.411765 45.285714 203.333333 34.970588 86.611111
#> [49] 65.470588 59.000000 214.000000 38.000000 171.285714 70.476190
#> [55] 54.906250 28.959184 83.111111 142.545455 42.382353 157.375000
#> [61] 72.142857 59.040000 45.400000 91.666667 118.888889 275.200000
#> [67] 50.300000 66.562500 143.200000 30.833333 135.333333 82.250000
#> [73] 68.333333 28.242424 48.550000 60.894737 118.333333 62.000000
#> [79] 224.166667 28.152174 58.210526 243.400000 39.121951 142.714286
#> [85] 43.222222 199.200000 84.307692 138.333333 79.090909 9.758621
#> [91] 174.000000 100.636364 78.666667 101.250000 88.000000 39.571429
#> [97] 36.052632 54.588235 79.583333 154.333333 170.500000 85.600000
#> [103] 109.714286 126.777778 49.625000 75.181818 274.400000 72.363636
#> [109] 79.142857 46.500000 158.166667 206.500000 58.958333 120.600000
#> [115] 252.200000 124.000000 117.750000 211.333333 86.600000 27.562500
#> [121] 92.428571 43.388889 94.166667 113.428571 119.714286 168.800000
#> [127] 39.142857 98.000000 66.285714 192.200000 135.222222 44.166667
#> [133] 99.250000 100.833333 19.294118 120.571429 124.571429 82.636364
#> [139] 146.500000 152.000000 122.666667 31.611111 38.444444 155.000000
#> [145] 65.200000 102.000000 112.428571 168.000000 196.285714 117.250000
#> [151] 174.200000 89.857143 53.500000 176.666667 161.600000 157.666667
#> [157] 86.454545 237.400000 193.833333 168.666667 62.714286 107.636364
#> [163] 48.625000 180.400000 170.000000 182.285714 56.250000 165.000000
#> [169] 89.615385 69.000000 117.111111 103.800000 138.375000 112.375000
#> [175] 85.250000 222.000000 174.200000 91.166667 147.800000 105.571429
#> [181] 81.400000 83.615385 110.833333 127.400000 91.777778 115.625000
#> [187] 156.444444 135.500000 117.666667 21.200000 49.214286 80.100000
#> [193] 124.400000 63.076923 183.666667 138.222222 63.076923 101.222222
#> [199] 48.800000 91.625000 44.166667 123.222222 26.333333 152.833333
#> [205] 86.200000 114.000000 158.200000 67.500000 99.142857 46.285714
#> [211] 97.600000 71.500000 99.750000 70.200000 135.666667 184.571429
#> [217] 203.000000 49.000000 217.600000 153.000000 188.400000 176.666667
#> [223] 29.500000 143.875000 162.000000 229.000000 77.714286 59.166667
#> [229] 115.125000 136.500000 117.428571 97.200000 177.600000 230.000000
#> [235] 196.000000 117.400000 51.000000 99.454545 39.583333 77.538462
#> [241] 95.400000 100.555556 191.400000 223.400000 93.000000 118.600000
#> [247] 116.125000 178.000000 167.625000 128.600000 61.400000 95.428571
#> [253] 198.000000 87.000000 97.400000 25.461538 225.600000 95.400000
#> [259] 172.200000 158.714286 77.000000 133.500000 143.400000 73.000000
#> [265] 186.833333 144.666667 122.333333 117.800000 112.600000 93.545455
#> [271] 83.888889 91.615385 121.600000 108.200000 119.666667 96.200000
#> [277] 194.000000 167.333333 165.600000 147.200000 99.400000 162.285714
#> [283] 62.230769 134.400000 119.200000 30.666667 59.714286 125.200000
#> [289] 139.000000 53.625000 20.714286 88.666667 146.800000 68.125000
#> [295] 190.500000 109.428571 70.000000 195.500000 86.800000 48.800000
#> [301] 24.166667 77.818182 77.375000 83.125000 118.400000 18.125000
#> [307] 52.000000 53.222222 114.142857 159.800000 68.500000 179.600000
#> [313] 90.800000 174.000000 95.600000 99.375000 171.400000 79.800000
#> [319] 74.833333 77.666667 69.000000 113.333333 108.800000 298.200000
#> [325] 155.500000 233.200000 125.666667 107.285714 79.428571 34.888889
#> [331] 53.700000 165.400000 88.000000 105.285714 57.222222 87.600000
#> [337] 160.800000 152.000000 121.833333 105.571429 155.857143 122.000000
#> [343] 179.142857 217.200000 75.333333 65.500000 129.000000 184.333333
#> [349] 73.900000 70.111111 122.666667 18.000000 69.181818 84.200000
#> [355] 41.833333 86.250000 59.500000 72.166667 122.800000 104.333333
#> [361] 116.600000 123.142857 89.400000 95.400000 119.000000 69.250000
#> [367] 107.000000 98.000000 109.000000 109.444444 96.666667 214.400000
#> [373] 125.666667 171.200000 44.000000 26.800000 80.400000 116.666667
#> [379] 100.800000 74.375000 182.000000 231.800000 134.800000 163.333333
#> [385] 161.833333 205.000000 87.833333 150.000000 64.142857 131.000000
#> [391] 139.000000 146.000000 196.833333 117.000000 151.200000 73.200000
#> [397] 174.857143 114.000000 30.714286 42.833333 82.800000 135.200000
#> [403] 36.000000 81.250000 54.700000 222.000000 102.142857 90.833333
#> [409] 79.375000 123.400000 92.000000 77.571429 197.333333 73.428571
#> [415] 106.000000 108.285714 116.800000 69.333333 32.200000 67.428571
#> [421] 152.800000 156.800000 114.166667 113.714286 111.142857 205.000000
#> [427] 140.000000 183.000000 139.333333 129.500000 272.800000 132.500000
#> [433] 156.800000 121.857143 135.600000 215.400000 76.833333 131.400000
#> [439] 109.428571 117.000000 128.833333 138.000000 156.000000 93.625000
#> [445] 84.625000 63.000000 77.600000 184.666667 157.000000 47.800000
#> [451] 126.500000 81.166667 144.833333 191.400000 29.833333 73.750000
#> [457] 105.111111 126.000000 79.600000 109.833333 85.666667 166.000000
#> [463] 180.200000 53.200000 30.400000 244.000000 69.333333 173.142857
#> [469] 163.857143 47.333333 88.000000 89.000000 214.400000 92.200000
#> [475] 88.428571 171.600000 179.400000 75.714286 137.800000 151.600000
#> [481] 184.333333 174.800000 109.400000 87.600000 93.600000 187.000000
#> [487] 122.500000 122.833333 123.142857 20.000000 130.666667 87.000000
#> [493] 152.000000 100.800000 204.400000 59.142857 103.833333 139.750000
#> [499] 76.666667 78.800000 54.000000 171.000000 121.714286 171.200000
#> [505] 70.666667 262.000000 58.000000 118.400000 161.400000 159.800000
#> [511] 101.200000 178.600000 142.800000 146.000000 188.200000 103.857143
#> [517] 109.200000 91.666667 131.000000 60.500000 67.000000 86.250000
#> [523] 130.833333 39.400000 167.666667 31.250000 116.333333 165.400000
#> [529] 67.400000 105.200000 190.000000 156.800000 210.400000 110.428571
#> [535] 44.000000 101.600000 269.000000 86.571429 208.400000 83.333333
#> [541] 222.400000 123.166667 159.000000 143.600000 177.200000 80.666667
#> [547] 110.200000 207.200000 193.800000 187.800000 130.600000 133.166667
#> [553] 21.500000 101.000000 147.500000 44.166667 77.166667 102.400000
#> [559] 153.400000 140.000000 113.000000 81.200000 129.200000 166.857143
#> [565] 101.600000 50.600000 20.333333 154.500000 90.800000 135.800000
#> [571] 197.800000 53.750000 69.666667 172.600000 94.600000 108.625000
#> [577] 228.400000 54.500000 145.800000 143.000000 73.200000 97.500000
#> [583] 40.000000 64.400000 164.600000 83.000000 121.833333 284.200000
#> [589] 128.600000 110.571429 168.333333 103.200000 110.142857 97.142857
#> [595] 83.500000 138.000000 233.600000 10.400000 75.800000 278.400000
#> [601] 207.166667 101.200000 109.500000 49.300000 175.600000 115.600000
#> [607] 172.500000 27.600000 146.800000 212.600000 92.571429 73.800000
#> [613] 156.000000 149.800000 183.000000 218.800000 107.800000 142.800000
#> [619] 158.600000 282.600000 123.600000 178.166667 100.666667 89.142857
#> [625] 163.000000 154.800000 121.800000 102.800000 152.000000 168.285714
#> [631] 176.000000 268.600000 88.666667 114.400000 127.333333 102.400000
#> [637] 184.800000 89.800000 96.400000 144.400000 110.600000 72.428571
#> [643] 102.166667 138.000000 144.600000 157.200000 65.833333 135.000000
#> [649] 62.857143 162.000000 36.600000 115.200000 128.600000 149.000000
#> [655] 116.571429 202.000000 228.600000 254.800000 158.000000 99.600000
#> [661] 107.400000 246.600000 47.200000 200.833333 75.800000 57.400000
#> [667] 148.000000 232.400000 124.400000 165.400000 242.000000 127.000000
#> [673] 55.800000 206.000000 230.400000 160.600000 77.333333 46.142857
#> [679] 74.200000 229.000000 113.333333 122.400000 188.666667 220.800000
#> [685] 181.400000 146.200000 56.800000 148.400000 198.400000 64.857143
#> [691] 147.600000 60.285714 112.800000 83.000000 281.600000 160.000000
#> [697] 100.142857 82.800000 170.000000 88.333333 145.000000 178.200000
#> [703] 68.600000 170.600000 135.400000 190.400000 38.500000 201.200000
#> [709] 171.200000 48.400000 138.400000 99.500000 189.200000 96.000000
#> [715] 176.400000 123.166667 130.333333 157.200000 170.333333 13.800000
#> [721] 249.200000 82.000000 138.800000 59.500000 49.800000 68.857143
#> [727] 120.600000 85.200000 175.600000 136.800000 19.285714 174.600000
#> [733] 28.333333 154.000000 87.400000 150.400000 179.333333 100.600000
#> [739] 189.142857 87.600000 173.166667 263.800000 74.400000 198.200000
#> [745] 22.000000 55.600000 181.166667 150.800000 74.000000 131.333333
#> [751] 86.285714 185.400000 137.333333 77.600000 40.333333 50.400000
#> [757] 33.000000 116.400000 90.000000 71.666667 100.800000 209.600000
#> [763] 253.800000 102.000000 82.833333 142.600000 17.142857 82.400000
#> [769] 136.000000 113.800000 83.800000 156.600000 89.400000 201.000000
#> [775] 270.400000 150.000000 161.800000 157.600000 170.600000 8.000000
#> [781] 127.000000 132.800000 37.000000 142.800000 150.200000 83.600000
#> [787] 134.600000 26.000000 162.200000 116.666667 148.400000 11.000000
#> [793] 163.400000 200.600000 69.400000 137.200000 27.833333 189.400000
#> [799] 39.400000 123.600000 140.000000 117.800000 42.000000 137.200000
#> [805] 128.400000 153.400000 208.600000 28.600000 24.600000 122.166667
#> [811] 171.400000 102.333333 127.000000 140.600000 98.000000 86.800000
#> [817] 91.600000 91.600000 125.500000 274.200000 68.800000 164.600000
#> [823] 28.000000 51.400000 123.600000 209.400000 40.400000 117.500000
#> [829] 67.166667 31.200000 130.166667 137.000000 105.600000 231.200000
#> [835] 32.800000 129.200000 181.200000 10.800000 145.000000 191.000000
#> [841] 268.600000 74.400000 169.000000 181.600000 40.200000 97.200000
#> [847] 17.800000 179.200000 74.200000 84.000000 175.800000 130.000000
#> [853] 102.800000 207.600000 15.600000 63.800000 90.200000 83.571429
#> [859] 49.600000 17.200000 84.000000 76.000000 153.000000 103.800000
#> [865] 60.600000 166.400000 220.200000 275.600000 31.000000 78.200000
#> [871] 114.600000 200.200000 104.000000 209.600000 214.800000 221.000000
#> [877] 131.200000 149.600000 168.000000 89.000000 72.000000 48.400000
#> [883] 198.800000 184.000000 163.000000 143.400000 144.400000 153.000000
#> [889] 204.000000 88.000000 83.600000 29.000000 117.400000 127.800000
#> [895] 111.400000 126.800000 43.400000 162.200000 30.200000 18.400000
#> [901] 169.000000 34.800000 127.000000 175.600000 70.600000 139.600000
#> [907] 76.600000 161.000000 90.800000 152.600000 124.800000 146.400000
#> [913] 165.833333 66.800000 167.800000 156.800000 170.200000 131.600000
#> [919] 108.400000 146.400000 199.200000 97.400000 147.400000 78.400000
#> [925] 249.000000 87.000000 115.800000 18.000000 120.200000 80.200000
#> [931] 77.800000 56.400000 70.333333 16.000000 83.400000 58.600000
#> [937] 209.200000 139.200000 84.600000 106.800000 139.600000 94.800000
#> [943] 143.400000 137.200000 24.600000 78.200000 146.800000 102.200000
#> [949] 77.600000 171.600000 39.600000 116.200000 128.600000 185.800000
#> [955] 77.600000 77.600000 108.200000 85.200000 96.800000 34.000000
#> [961] 80.000000 133.600000 66.800000 133.000000 93.800000 188.400000
#> [967] 197.600000 70.600000 90.400000 133.200000 88.200000 45.200000
#> [973] 113.600000 146.800000 92.400000 180.000000 140.800000 196.800000
#> [979] 215.200000 105.166667 93.200000 198.400000 85.600000 146.600000
#> [985] 82.600000 219.000000 195.800000 24.800000 59.600000 172.800000
#> [991] 130.400000 179.200000 185.000000 178.000000 141.200000 160.600000
#> [997] 152.800000 135.400000 82.400000 91.000000
#>
#> $knnk
#> [1] NaN NaN NaN NaN 134.57579 118.48750 103.71586
#> [8] 95.50581 97.70370 83.88182 89.86364 70.55303 70.95385 48.08333
#> [15] 76.11111 62.00893 51.19118 49.46296 50.90789 49.42500 67.36508
#> [22] NaN NaN 50.15625 62.92000 58.01282 56.40741 NaN
#> [29] 31.50000 NaN 43.58065 45.03125 33.12121 41.67647 44.08571
#> [36] 30.83333 50.67568 NaN 48.92308 NaN 39.12195 NaN
#> [43] NaN 33.93182 NaN 28.15217 NaN NaN 28.95918
#> [50] NaN NaN NaN NaN NaN NaN 33.46429
#> [57] NaN NaN 30.45763 27.85000 NaN NaN NaN
#> [64] NaN NaN NaN 30.26866 18.16176 32.85507 NaN
#> [71] NaN NaN NaN NaN NaN 22.42105 NaN
#> [78] NaN NaN NaN NaN 27.06098 NaN NaN
#> [85] NaN 19.08140 NaN NaN NaN NaN NaN
#> [92] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [99] NaN NaN NaN NaN 22.73786 NaN NaN
#> [106] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [113] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [120] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [127] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [134] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [141] NaN NaN NaN NaN NaN NaN 19.27891
#> [148] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [155] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [162] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [169] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [176] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [183] NaN NaN NaN NaN NaN NaN 16.26984
#> [190] NaN 18.27749 NaN NaN NaN NaN NaN
#> [197] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [204] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [211] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [218] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [225] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [232] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [239] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [246] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [253] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [260] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [267] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [274] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [281] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [288] NaN NaN 16.18276 NaN NaN NaN NaN
#> [295] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [302] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [309] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [316] 14.94304 NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [323] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [330] NaN NaN 14.56024 NaN NaN NaN NaN
#> [337] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [344] NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN
#> [351] NaN NaN NaN NaN 14.59718 NaN NaN
#> [358] NaN NaN NaN NaN 13.63536
#>
# A random graph
g4 <- sample_gnp(1000, p = 5 / 1000)
knn(g4)
#> $knn
#> [1] 5.571429 5.285714 5.800000 6.800000 7.000000 6.400000 5.600000
#> [8] 6.400000 5.272727 5.000000 6.230769 8.750000 6.600000 6.333333
#> [15] 7.250000 6.333333 6.750000 5.500000 5.000000 6.363636 8.200000
#> [22] 8.000000 5.500000 5.500000 5.333333 6.111111 5.500000 6.250000
#> [29] 6.000000 5.625000 5.500000 5.000000 5.375000 5.666667 6.833333
#> [36] 6.400000 5.714286 5.000000 5.800000 8.000000 5.000000 5.000000
#> [43] 4.800000 5.833333 5.250000 6.285714 7.500000 5.428571 6.125000
#> [50] 7.500000 6.666667 4.000000 6.666667 7.750000 6.666667 6.000000
#> [57] 5.666667 7.000000 4.714286 5.750000 4.000000 6.555556 6.000000
#> [64] 4.500000 5.000000 4.000000 5.000000 3.500000 7.000000 7.666667
#> [71] 7.142857 5.750000 9.333333 6.142857 5.333333 4.800000 4.250000
#> [78] 8.000000 5.666667 3.875000 5.833333 7.000000 5.857143 5.625000
#> [85] 6.666667 6.333333 7.428571 4.000000 5.714286 6.500000 5.166667
#> [92] 4.333333 8.000000 6.166667 8.000000 6.250000 5.666667 8.333333
#> [99] 4.750000 5.800000 7.000000 4.666667 6.666667 6.400000 5.666667
#> [106] 6.600000 5.625000 7.800000 7.200000 6.500000 7.333333 7.500000
#> [113] 8.750000 6.000000 7.000000 7.200000 6.571429 7.000000 6.600000
#> [120] 6.400000 4.777778 6.500000 5.200000 6.200000 4.500000 7.500000
#> [127] 6.000000 6.666667 9.500000 7.000000 4.333333 7.666667 6.250000
#> [134] 6.500000 6.000000 6.250000 5.555556 6.000000 6.000000 8.333333
#> [141] 6.500000 5.571429 5.333333 4.000000 5.000000 5.833333 NaN
#> [148] 4.750000 6.250000 6.000000 5.142857 6.500000 5.200000 5.571429
#> [155] 6.666667 5.800000 5.333333 6.666667 7.333333 4.500000 8.200000
#> [162] 8.200000 5.000000 5.600000 6.200000 4.000000 6.000000 6.200000
#> [169] 5.833333 5.000000 5.600000 6.000000 4.333333 5.600000 5.400000
#> [176] 6.333333 5.200000 6.428571 6.333333 7.000000 7.666667 6.000000
#> [183] 5.000000 7.000000 NaN 4.333333 5.250000 6.600000 4.750000
#> [190] 4.625000 6.800000 NaN 6.750000 5.400000 4.000000 8.000000
#> [197] 7.500000 7.000000 5.500000 7.833333 5.600000 6.666667 6.200000
#> [204] 5.750000 5.000000 6.000000 5.250000 6.750000 5.714286 9.500000
#> [211] 4.800000 5.333333 4.600000 7.000000 5.714286 6.666667 6.111111
#> [218] 6.000000 6.000000 8.250000 4.400000 5.200000 8.000000 5.333333
#> [225] 4.600000 5.500000 4.750000 4.000000 5.000000 6.333333 6.363636
#> [232] 5.750000 7.857143 7.125000 5.833333 5.000000 6.500000 5.800000
#> [239] 5.500000 5.857143 7.000000 6.250000 6.200000 6.200000 6.250000
#> [246] 6.000000 7.500000 6.111111 6.166667 5.777778 6.250000 6.200000
#> [253] 6.000000 5.714286 2.500000 5.800000 6.250000 8.571429 3.000000
#> [260] 6.400000 6.500000 4.500000 5.250000 6.000000 5.666667 7.800000
#> [267] 5.666667 5.750000 6.750000 5.750000 6.200000 6.400000 6.000000
#> [274] 4.333333 4.500000 6.166667 5.333333 6.000000 6.700000 6.400000
#> [281] 7.800000 5.142857 5.000000 6.666667 8.800000 5.000000 4.000000
#> [288] 8.200000 6.000000 6.400000 7.200000 5.600000 6.800000 5.250000
#> [295] 6.500000 6.666667 5.777778 6.142857 4.800000 6.000000 4.500000
#> [302] 6.625000 4.500000 6.000000 6.666667 7.400000 5.444444 7.636364
#> [309] 7.000000 5.500000 6.857143 5.400000 6.000000 6.333333 7.166667
#> [316] 5.500000 4.333333 7.666667 7.000000 4.000000 6.166667 4.833333
#> [323] 6.000000 7.222222 5.800000 4.600000 5.600000 6.500000 5.333333
#> [330] 9.000000 6.142857 6.600000 7.400000 7.500000 6.200000 6.000000
#> [337] 6.714286 5.333333 6.500000 6.333333 5.200000 8.000000 7.000000
#> [344] 7.400000 3.500000 8.666667 4.833333 6.000000 5.200000 5.571429
#> [351] 7.666667 7.000000 5.833333 6.100000 5.333333 6.666667 9.000000
#> [358] 6.500000 7.833333 6.500000 5.166667 5.400000 6.222222 7.428571
#> [365] 7.500000 7.666667 6.250000 6.333333 6.571429 6.250000 8.833333
#> [372] NaN 7.000000 6.250000 7.666667 4.333333 6.833333 6.285714
#> [379] 8.500000 5.625000 5.400000 7.666667 8.000000 6.500000 6.285714
#> [386] 4.000000 5.000000 5.700000 6.000000 6.714286 8.166667 4.333333
#> [393] 6.666667 4.333333 7.000000 6.800000 7.000000 6.500000 6.750000
#> [400] 7.400000 5.777778 6.250000 7.000000 6.400000 6.600000 5.500000
#> [407] 6.500000 4.800000 7.666667 6.750000 7.750000 7.000000 5.166667
#> [414] 8.142857 3.500000 6.875000 5.200000 8.000000 7.000000 5.600000
#> [421] 5.857143 6.750000 7.666667 6.500000 6.571429 7.400000 6.833333
#> [428] 4.666667 6.500000 6.875000 6.444444 8.500000 4.750000 7.750000
#> [435] 6.250000 5.600000 5.166667 7.750000 7.500000 7.000000 6.250000
#> [442] 4.833333 6.571429 5.666667 6.166667 5.000000 5.750000 6.000000
#> [449] 5.400000 5.625000 5.200000 7.000000 8.000000 6.714286 6.250000
#> [456] 6.333333 5.333333 8.000000 5.000000 7.000000 6.500000 3.500000
#> [463] 6.666667 5.666667 6.333333 5.666667 4.500000 6.833333 5.500000
#> [470] 5.555556 4.000000 7.100000 5.400000 4.250000 6.200000 5.600000
#> [477] 5.000000 5.250000 7.000000 5.000000 6.333333 7.166667 5.285714
#> [484] 7.000000 7.000000 9.666667 6.666667 4.750000 6.714286 6.800000
#> [491] 6.166667 5.200000 9.000000 8.500000 7.500000 5.375000 4.500000
#> [498] 6.500000 5.857143 4.285714 5.833333 5.857143 5.833333 4.571429
#> [505] 7.500000 5.000000 8.000000 6.625000 6.000000 7.400000 8.000000
#> [512] 4.333333 5.250000 4.500000 6.500000 6.600000 6.666667 6.666667
#> [519] 4.000000 5.000000 5.400000 6.076923 9.333333 6.714286 7.333333
#> [526] 4.500000 4.200000 6.666667 7.000000 5.555556 6.700000 5.500000
#> [533] NaN 7.333333 6.142857 6.166667 7.000000 5.500000 5.000000
#> [540] 5.000000 7.000000 6.333333 4.714286 6.000000 6.428571 5.600000
#> [547] 7.200000 6.750000 6.142857 6.111111 6.000000 6.500000 5.600000
#> [554] 3.000000 4.833333 6.166667 5.666667 4.571429 4.888889 9.333333
#> [561] 6.300000 3.000000 7.500000 4.600000 7.333333 5.250000 5.875000
#> [568] 7.000000 6.400000 6.333333 5.666667 4.000000 7.750000 4.000000
#> [575] 6.000000 5.000000 4.800000 6.250000 8.000000 7.500000 7.000000
#> [582] 6.571429 7.333333 6.500000 6.333333 7.250000 8.000000 5.400000
#> [589] 5.333333 8.666667 8.750000 6.400000 6.333333 4.666667 7.000000
#> [596] 6.000000 9.000000 NaN 7.333333 5.000000 7.000000 4.375000
#> [603] 5.333333 7.600000 7.500000 8.000000 7.333333 5.714286 6.250000
#> [610] 5.333333 5.125000 5.111111 6.000000 5.333333 6.833333 7.000000
#> [617] 5.727273 6.000000 6.600000 4.333333 7.600000 6.000000 6.166667
#> [624] 6.000000 7.250000 6.375000 5.500000 5.000000 4.250000 4.000000
#> [631] 7.250000 5.666667 5.500000 6.666667 5.333333 6.800000 7.000000
#> [638] 5.500000 6.600000 5.333333 4.800000 5.285714 6.222222 9.400000
#> [645] 7.000000 5.600000 7.250000 3.714286 6.800000 6.750000 5.800000
#> [652] 6.000000 5.666667 7.250000 5.857143 4.666667 6.500000 6.666667
#> [659] 5.800000 6.833333 4.428571 5.571429 6.285714 5.285714 10.000000
#> [666] 4.666667 4.200000 6.500000 5.142857 6.666667 5.444444 7.000000
#> [673] 4.400000 6.200000 7.000000 5.333333 5.000000 8.000000 6.200000
#> [680] 7.000000 7.000000 5.500000 5.500000 5.625000 7.166667 6.142857
#> [687] 6.285714 5.166667 6.500000 3.833333 6.400000 2.666667 5.000000
#> [694] 6.000000 6.166667 5.800000 6.500000 7.000000 6.400000 6.857143
#> [701] 4.750000 6.000000 6.000000 5.600000 6.333333 4.500000 5.000000
#> [708] 7.800000 7.750000 5.666667 6.600000 5.000000 4.000000 7.000000
#> [715] 7.000000 5.500000 6.800000 6.500000 6.833333 6.833333 6.800000
#> [722] 5.000000 5.875000 8.500000 6.100000 5.166667 4.500000 4.333333
#> [729] 6.625000 7.000000 3.857143 5.833333 7.000000 5.333333 5.700000
#> [736] 9.000000 6.666667 6.000000 6.000000 6.333333 6.444444 5.875000
#> [743] 4.600000 7.125000 6.666667 6.000000 6.833333 7.400000 7.000000
#> [750] 6.600000 6.333333 4.000000 5.500000 6.400000 4.800000 5.333333
#> [757] 6.000000 5.800000 5.666667 6.200000 6.250000 6.333333 6.444444
#> [764] 5.666667 6.666667 6.250000 5.500000 5.888889 5.750000 4.333333
#> [771] 5.250000 4.666667 5.800000 4.600000 6.000000 6.250000 6.666667
#> [778] 5.500000 5.666667 4.200000 5.750000 6.400000 5.000000 7.333333
#> [785] 6.000000 8.000000 6.000000 5.400000 6.400000 6.285714 6.500000
#> [792] 5.000000 6.000000 7.000000 6.800000 6.700000 5.285714 5.750000
#> [799] 6.333333 5.444444 6.000000 6.000000 6.333333 6.500000 5.250000
#> [806] 8.000000 7.500000 6.000000 5.333333 4.800000 7.875000 6.250000
#> [813] 6.000000 5.875000 8.000000 6.285714 4.750000 6.166667 7.000000
#> [820] 6.200000 5.400000 5.600000 7.600000 7.000000 6.000000 6.000000
#> [827] 8.000000 5.200000 5.333333 5.600000 5.666667 4.800000 5.750000
#> [834] 5.000000 7.444444 5.500000 7.666667 6.800000 5.500000 8.666667
#> [841] 7.000000 6.166667 5.000000 6.375000 4.428571 6.000000 6.333333
#> [848] 5.333333 7.500000 5.833333 7.000000 NaN 5.666667 5.000000
#> [855] 5.800000 6.000000 4.666667 6.666667 5.250000 4.000000 7.000000
#> [862] 5.500000 5.600000 7.375000 7.800000 5.000000 6.200000 5.142857
#> [869] 6.500000 7.000000 5.166667 6.500000 5.333333 NaN 7.600000
#> [876] 3.333333 4.000000 6.000000 5.750000 5.333333 6.000000 7.000000
#> [883] 4.500000 6.000000 8.000000 7.000000 6.444444 5.333333 7.400000
#> [890] 6.600000 5.000000 5.000000 6.714286 6.222222 5.600000 5.333333
#> [897] 6.333333 6.600000 7.250000 2.500000 7.166667 5.750000 3.500000
#> [904] 5.000000 6.300000 4.500000 5.571429 5.000000 8.000000 6.400000
#> [911] 4.857143 5.714286 4.666667 4.500000 6.000000 5.750000 NaN
#> [918] 5.571429 6.000000 4.600000 5.000000 6.333333 4.714286 3.250000
#> [925] 4.333333 5.250000 8.000000 6.800000 5.250000 6.100000 6.500000
#> [932] 4.250000 5.250000 6.500000 7.500000 NaN 5.428571 6.000000
#> [939] 7.000000 4.500000 7.000000 6.000000 7.000000 6.000000 5.250000
#> [946] 6.000000 5.818182 7.200000 6.000000 5.500000 6.750000 5.500000
#> [953] 5.000000 6.000000 6.000000 5.600000 5.600000 7.000000 7.000000
#> [960] 5.000000 6.500000 5.500000 5.900000 6.250000 6.750000 6.500000
#> [967] 4.333333 7.800000 6.000000 7.200000 7.333333 5.166667 4.857143
#> [974] NaN 8.666667 4.166667 5.000000 5.666667 6.600000 5.600000
#> [981] 5.200000 5.428571 8.666667 6.500000 5.375000 6.000000 4.333333
#> [988] 6.555556 5.333333 7.400000 7.333333 2.000000 5.000000 5.833333
#> [995] 6.250000 6.000000 5.888889 6.200000 4.833333 NaN
#>
#> $knnk
#> [1] 5.964286 5.782895 6.258547 6.132353 6.155080 6.105145 5.913323 6.034420
#> [9] 6.012346 6.130435 6.025974 5.854167 6.153846
#>
# A weighted graph
g5 <- make_star(10)
E(g5)$weight <- seq(ecount(g5))
knn(g5)
#> $knn
#> [1] 1 9 9 9 9 9 9 9 9 9
#>
#> $knnk
#> [1] 9 NaN NaN NaN NaN NaN NaN NaN 1
#>